De kralencollectie Van der Sleen
In het museum wordt de kralencollectie van Dr. W.G. N. van der Sleen (1886-1967) bewaard. Deze chemicus hield zich als één van de eersten op een wetenschappelijke manier met kralen bezig en publiceerde in 1967 A Handbook on Beads. Zijn studiecollectie, bestaande uit ca. 20.000 kralen, is aan de Universiteit van Amsterdam geschonken. Sinds 1989 bevindt de verzameling kralen zich in het Allard Pierson Museum, waar zij regelmatig voor geïnteresseerden uit de hele wereld wordt opengesteld voor onderzoek. De kralen zijn naar herkomst geordend. Een catalogus met informatie over materiaal, techniek en herkomst (voor zover bekend) is aanwezig.

Belangrijk binnen de collectie zijn de 'Trade Wind beads' uit India en de Amsterdamse kralen. Deze kralen zijn verbonden met twee belangrijke ontdekkingen van Dr. Van der Sleen. De eerste daarvan is dat de Trade Wind beads die op de Oostkust van Afrika, maar ook in Indonesië en China gevonden zijn, alle uit India komen: zij werden door Indiase en Arabische handelaren als ruilwaar gebruikt. Ten tweede ontdekte hij dat bepaalde kralen die als Egyptisch, Romeins of Venetiaans te boek stonden, in de 17de eeuw in Amsterdam gemaakt zijn. Hier waren verschillende glashuizen die speciaal voor de ruilhandel in het Verre Oosten en Amerika kralen fabriceerden.

De kralen uit de collectie komen van over de hele wereld en uit allerlei perioden. Uit de oudheid zijn er kralen uit Egypte, Iran, Griekenland en het Romeinse Rijk. Verder zijn er Europese glazen kralen uit Venetië en Amsterdam. Afrika, India en Indonesië zijn goed vertegenwoordigd, Amerika minder.

Behalve de Van der Sleen collectie bezit het museum kralensnoeren, uit Egypte, Iran en de Grieks-Romeinse wereld. Bijzonder zijn de Phoenicische gezichtskralen.